宏基因组测序 16S rDNA测序 转录组 蛋白质组学 代谢组学 宏病毒组 动植物基因De novo测序 动植物基因组重测序测序 细菌de novo测序 细菌重测序 真菌denovo测序 真菌重测序 |
宏基因组
1.产品简介
宏基因组(Metagenomics),也称元基因组,利用新一代高通量测序技术(NextGeneration Sequencingtechnology, NGS)以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上,可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。与传统微生物研究方法相比,宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。
16S测序
1.产品简介
16SrDNA是原核生物编码16SrRNA的基因,长度约为1500bp,由10个保守区和9个可变区(V1-V9)组成,可变区反映了物种间的差异性。16SrDNA-seq是通过提取微生物菌群的DNA,选择可变区的特定区段(V3-V4)进行PCR扩增,再通过高通量测序的方法,帮助研究人员分析特定环境中微生物群体基因组成及功能、微生物群体的多样性与丰度,进而分析微生物与环境、微生物与宿主之间的关系,发现具有特定功能的基因。在医学领域,主要应用于肠道微生物与疾病的关联分析,揭示疾病与健康个体间微生物的差异,研究药物或饮食干扰后菌群差异,或某一病程发展过程中肠道菌群的变化,如结直肠癌等。
转录组测序
1.产品简介
转录组测序,对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量的二代测序,既能够定量分析,检测基因表达水平的差异,又能够提供结构分析,可以发现稀有的转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合等,而且不需要依赖于参考基因组。
蛋白质组学
1.产品简介
定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。
代谢组学
非靶向代谢组学:基于液质联用技术(LC-MS),无偏向性、尽可能多地检测细胞、组织、器官或体液等生物样本内所有的小分子代谢物,对实验组和对照组进行对比分析,通过统计分析筛选差异代谢物,对差异代谢物进行代谢通路分析,进而寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。
宏病毒组
1.产品简介
病毒宏基因组测序又称宏病毒组(Virome),是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定环境中所有的病毒组成,是一种发现新病毒、病毒感染预警和控制的有力手段,在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。
动植物基因组De novo测序
1.产品简介
动植物基因组De novo测序分析也叫从头测序分析,指不依赖于任何参考序列信息就可对某动植物进行测序分析,使用最新的生物信息学方法进行序列拼接获得某物种的基因组序列图谱,并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。三代测序技术(以PacBio和Nanopore为代表)具有读长长的特点。该类型测序分析结果可以广泛应用于农林鱼牧医药及海洋等各个方面的研究。
动植物基因组重测序测序
1.技术简介
动植物基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。它可以获取最全的基因组信息,找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、杂合性缺失(LOH)、拷贝数变异(CNV)以及基因组重排导致的结构变异位点(SV,Structure Variation)。通过生物信息手段,分析不同个体基因组间的结构差异,同时完成注释。
细菌de novo
1.产品简介
细菌基因组denovo测序,即从头测序,是指在没有任何现有的序列信息的情况下,对某个细菌物种进行测序,利用生物信息学分析手段对序列进行拼装,从而获得该细菌物种的基因组序列。随着高通量测序技术和生物信息学的快速发展,细菌全基因组denovo测序已成为一种探究细菌生物学问题的高性价比方法。通过全基因组测序,可以获知待测菌株的基因及相关调控信息,为研究该菌株特有的生物学特征提供分子基础;通过比较基因组分析,可以研究种内及种间的相互进化关系,为探究疾病的传播机制提供理论指导。
目前,细菌基因组测序已经广泛应用于细菌流行病学、疫苗开发、微生物进化等多个领域。此外,细菌全基因组denovo测序也能为该物种后续基因组数据的挖掘以及重要基因的功能分析构建一个全面的研究平台。
细菌重测序
1.产品简介
细菌基因组重测序是指对基因组序列已知的细菌个体进行基因组测序,通
过与已知的参考基因组比对,获得该细菌个体或群体的差异的测序方法。这些
差异主要包括:SNP(单核苷酸多态性位点,Single Nucleotide
Polymorphism、InDel(插入缺失位点, lnsertion & Deletion)、SV(结构
变异位点,Structural Variation)。将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。通过双末端(Paired-End)测序,检测基因序列间的位点差异和结构变异,在全基因组水平上解释导致性状差异的原因。
真菌denovo测序
1.产品简介
真菌denovo测序,又叫真菌基因组从头测序,指不依赖于任何参考序列信息就可对某个真菌进行分析的测序分析技术,用生物信息学的方法进行序列拼接,可以预测真菌基因组中所包含的基因,从而获得该物种的基因组序列图谱,并进行功能注释等一系列的数据分析。
真菌基因组de novo测序,是一种在无参考基因组的情况下,对微生物基因组序列进行从头组装,并结合数据库对基因组进行注释,以此为基础开展相关下游分析的产品。
真菌重测序
1.产品简介
基因组重测序是对已知的基因组进行测序,并对个体或者群体样品进行分析。真菌重测序可以辅助研究者发现真菌单核苷酸多态性位点(SNPs)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。通过双末端(Paired-End)测序,检测基因序列间的位点差异和结构变异,在全基因组水平上解释导致性状差异的原因。
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